DNA-Ligase (ATP, ADP oder GTP) EC#: 6.5.1.7; ChemWhat Code: 1383899

Produktname DNA-Ligase (ATP, ADP oder GTP)
Beispielstruktur Beispielstruktur der DNA-Ligase (ATP, ADP oder GTP) EC #: 6.5.1.7
Synonyme Hbu-DNA-Ligase, multiple Cofaktor-abhängige DNA-Ligase, Szi-DNA-Ligase
EG-Nummer 6.5.1.7
CAS Registry Number
Ihre Nachricht Die Enzyme aus den Archaeen "Hyperthermus butylicus" und "Sulfophobococcus zilligii" sind mit ATP, ADP oder GTP aktiv. Sie zeigen keine Aktivität mit NAD +. Das Enzym katalysiert die Ligation von DNA-Strängen mit 3'-Hydroxyl- und 5'-Phosphat-Termini, bildet einen Phosphodiester und versiegelt bestimmte Arten von Einzelstrangbrüchen in Duplex-DNA. Die Katalyse erfolgt durch einen dreistufigen Mechanismus, beginnend mit der Aktivierung des Enzyms durch ATP, ADP oder GTP, wobei eine Phosphoramidbindung zwischen Adenylat / Guanylat und einem Lysinrest gebildet wird. Das Nukleotid wird dann auf den 5'-Phosphat-Terminus des Substrats übertragen und bildet die verkappte Struktur 5 '- (5'-Diphosphoadenosin / Guanosin) - [DNA]. Schließlich katalysiert das Enzym einen nukleophilen Angriff des 3'-OH-Terminus auf den verkappten Terminus, was zur Bildung der Phosphodiesterbindung und zur Freisetzung des Nukleotids führt. Anders als EC? 6.5.1.1, DNA-Ligase (ATP) und EC? 6.5.1.6, DNA-Ligase (ATP oder NAD +), die kein GTP verwenden können.
Cofaktor
Geschichte
Reaktionen (1) Atp + (Desoxyribonukleotid) (n) -3'-Hydroxyl + 5'-Phospho- (Desoxyribonukleotid) (m) = (Desoxyribonukleotid) (n + m) + Amp + Diphosphat. (2) Adp + (Desoxyribonukleotid) (n) -3'-Hydroxyl + 5'-Phospho- (Desoxyribonukleotid) (m) = (Desoxyribonukleotid) (n + m) + Amp + Phosphat. (3) Gtp + (Desoxyribonukleotid) (n) -3'-Hydroxyl + 5'-Phospho- (Desoxyribonukleotid) (m) = (Desoxyribonukleotid) (n + m) + Gmp + Diphosphat.

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